内镜室以粤东地区最大的肿瘤防治中心为依托，经长期大量的工作（迄今已完成各种诊疗操作超过20 000例次），在消化道及呼吸道良恶性肿瘤的内镜诊断与治疗方面积累了丰富的临床经验，是粤东地区最早开展恶性肿瘤内镜下治疗的科室之一。

我科现拥有电子胃镜，电子肠镜，电子支气管镜，电子鼻咽喉镜等各种内镜系统，并于2011年更新内镜操作系统，新增了电子鼻胃镜、放大内镜、电子染色内镜等先进仪器。
目前广泛开展各种先进的内镜下诊疗技术，包括常规的电子胃肠镜检查、电子鼻咽喉镜检查、电子支气管镜检查和超声内镜检查，以及内镜下相关治疗：内镜下肿物穿刺活检术，消化道肿瘤晚期姑息性对症治疗（食管狭窄扩张及支架植入、胃造瘘术等），内镜下肌切开术（治疗贲门失弛缓症），腔内良恶性肿瘤粘膜剥离/切除术等微创手术，在粤东地区位于领先水平
  我科在2012年引进粤东第一台超声内镜系统，超声内镜的应用有助于消化道和呼吸道良恶性肿瘤的鉴别，恶性肿瘤浸润及转移范围的确定，以及黏膜下肿物穿刺活检操作，为我们提高诊疗水平、更好的服务于广大患者提供良好的工具，也充分展现了我院在肿瘤诊疗技术上的先进性。